NIVA Danmark

Home » Nyheder » Ny R-pakke “ambiR” gør beregning af bentiske indeks nemmere

Ny R-pakke “ambiR” gør beregning af bentiske indeks nemmere

En ny R-pakke, ambiR, er nu tilgængelig og giver forskere et effektivt værktøj til at beregne både AMBI-indekset og det multivariate M-AMBI, baseret på artsdata for bundfauna. AMBI (AZTI’s Marine Biotic Index) blev oprindeligt udviklet af Ángel Borja et al. (2000) og bruges bredt i marin økologisk overvågning. Herudover er det også muligt at beregne forskellige versioner af Danish Quality Index (DKI) (Dansk Kvalitetsindeks), som er et index afledt fra AMBI.

Hvad kan ambiR?

  • AMBI() – beregner det klassiske AMBI-indeks
  • MAMBI() – beregner det multivariate M-AMBI
  • Hdash() – beregner Shannon’s diversitetsindeks (H’)
  • DKI2()  – beregner salinitet normaliseret DKI
  •  DKI() – beregner den danske DKI

Derudover indeholder pakken en indbygget artsliste, så brugerne hurtigt kan komme i gang uden behov for ekstern referenceopslag.

Guide til installation, samt eksempler på brug af pakken, kan findes via følgende via følgende link.  

For ydeligere information, kontakt Seniorforsker Ciarran Murray på ciaran.joseph.murray@niva-dk.dk

Discover more from NIVA Danmark

Subscribe now to keep reading and get access to the full archive.

Continue reading